Adjoint au grand rabbin de Lyon depuis 1936, Bernard Schönberg est mobilisé en 1939 comme aumônier militaire puis, démobilisé à l'été 1940, reprend ses activités religieuses à Lyon. Il est alors aumônier des prisons et des hôpitaux ce qui lui permet de porter assistance aux résistants incarcérés et de transmettre des documents importants. Il est lui-même membre de l'Armée juive.
Il est arrêté le 26 mai 1943 à Ambérieu-en-bugey. Détenu à la prison de Montluc, il est transféré à Drancy le 9 juin et déporté à Auschwitz-Birkenau par le convoi 62 du 20 novembre 1943.
Un témoin rapporte qu'il est mort d'épuisement au camp de Monowitz (Auschwitz III) en février 1944.